申请高新技术企业审计需要准备一下资料：

1、企业法人营业执照（副本复印件）

2、验资报告、评估报告等

3、上年度的审计报告

4、章程以及合同

5、年度会计决算报表或者中期报表

6、会计账簿以及会计凭证

7、会计科目余额表

8、存货及固定资产的盘点表

9、现金盘点表以及银行对账单

10、长期投资中的被投资单位的营业执照、章程以及会计报表

11、借款、贷款、投资合同或者是协议书

12、纳税申报表以及缴款书

13、项目例项书

14、专利著作权等证书

15、高新产品服务)合同

16、《高薪技术企业认定申请书》《企业注册登记表》

17、企业科技人员和研究开发人员的劳动合同

18、技术创新活动证明材料

19、业务约定书及管理当局说明书，另外还需要三年的研发费用台账以及收入表和自测表

以上就是申请高新技术企业审计所需要的材料。